La collezione permanente del museo riguarda in generale l'arte europea e americana del Novecento.
Si possono ammirare i capolavori dei grandi dell'arte moderna, da Wahrol a Basquiat, passando per artisti baschi e spagnoli.
All'ingresso due animali "proteggono" il Guggenheim e la città: Puppy, cagnolone gigante di acciaio inossidabile, ma rivestito di piante e fiori stagionali ed una mamma ragno gigante, con i piccoli nella pancia, simbolo di vita e protezione.